La determinación de anticuerpos contra la fracción microsomal de la glándula tiroides se utiliza para diagnosticar la tiroiditis autoinmune y el hipotiroidismo, en los cuales aumenta el nivel de anticuerpos en sangre. Los anticuerpos contra los microsomas tiroideos forman inmunocomplejos en la superficie celular, activan el complemento y los linfocitos citotóxicos, lo que provoca la destrucción celular y la aparición de un proceso inflamatorio en la glándula tiroides.