Un nuevo método permitirá desarrollar fármacos más rápidamente

Un grupo internacional de científicos de Francia, Estados Unidos y Rusia ha desarrollado un nuevo método único para la creación de fármacos, que difiere de los existentes actualmente por su velocidad. Gracias a este nuevo método de modelado de interacciones entre proteínas, será posible acelerar el desarrollo de vacunas y fármacos, y los bioquímicos también tendrán un nuevo potencial para la investigación.

Ahora los científicos se enfrentan a la tarea de desarrollar fármacos que no causen efectos secundarios, sean completamente absorbidos por el organismo y destruyan únicamente las células enfermas. Para una célula, la proteína es el principal material de construcción; en ella se producen numerosas interacciones (cientos de miles), y el estudio de estos procesos permitirá a los científicos desarrollar nuevos métodos para tratar enfermedades peligrosas y crear nuevos materiales biológicos para la invención de fármacos.

Especialistas de diferentes países, bajo la dirección del profesor Dmitry Kozakov de la Universidad Stony Brook, lograron crear y estudiar un modelo informático capaz de calcular estructuras formadas durante la interacción de dos proteínas varias veces más rápido (el nuevo modelo es decenas de veces más rápido que los sistemas similares que existen hoy en día).

Según los científicos, los estudios de laboratorio son bastante costosos, ya que requieren reactivos y equipos costosos. Para grupos de investigación pequeños, la mejor opción es el modelado computacional. Actualmente existen numerosos sistemas informáticos que calculan la interacción entre proteínas, pero, lamentablemente, no todos los sistemas existentes son capaces de calcular un gran número de interacciones proteicas en poco tiempo. Todos los algoritmos utilizados actualmente monitorizan las configuraciones por separado, sin combinarlas, y el nuevo método del equipo del profesor Kozakov permite analizar todos los complejos simultáneamente en poco tiempo, lo que permite acelerar el proceso hasta 100 veces sin afectar la calidad del resultado final.

Utilizando un modelo informático como base, los especialistas podrán no solo desarrollar fármacos más rápidamente, sino también reducir significativamente su coste. El nuevo método de modelado informático permite no solo calcular las interacciones de proteínas, sino también analizar la estructura de los organismos vivos (tanto animales como humanos). Según los especialistas, el nuevo método permitirá desarrollar fármacos eficaces contra el VIH y las enfermedades oncológicas, y en poco tiempo será posible preparar una cantidad suficiente de fármacos.

Los científicos publicaron un artículo con los resultados de su trabajo en una de las revistas científicas, en el que los especialistas describen en detalle un nuevo método de modelado informático de las interacciones de proteínas.

Este trabajo no está destinado a uso comercial, sino a un estudio fundamental, por lo que podemos hablar del trabajo realizado desde el momento en que aparece en una publicación científica. Actualmente, el nuevo algoritmo ya se utiliza en el servidor público ClusPro como un nuevo sistema informático y está disponible para todos.

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