El tratamiento de la infección meningocócica depende de la forma clínica de la enfermedad. En caso de nasofaringitis, el tratamiento es sintomático. Si el diagnóstico se confirma bacteriológicamente, se utilizan bencilpenicilina, ampicilina, cefalosporinas de primera y segunda generación, cloranfenicol y pefloxacino en dosis terapéuticas promedio durante 3 días. No se deben utilizar cotrimoxazol ni aminoglucósidos, a los cuales la mayoría de las cepas de meningococo existentes actualmente son resistentes.